• Ректорат НовГУ
• Военный учебный центр
• Первый отдел
• Ассоциация выпускников НовГУ  
• Музей истории НовГУ 
• Отдел стратегического развития 
• Центр творческой интеллигенции имени В.В.Сороки
• Высшая гуманитарная школа "Антоново"
     - НОЦ "Гуманитарная урбанистика"
• Передовая инженерная школа "Распределенные системы управления технологическими процессами"
  - Лаборатория "Виртуальной и дополненной реальности"
  - Лаборатория "Интеллектуальная электроника"
  - Лаборатория "Информационных систем"
  - Лаборатория "Искусственный интеллект"
  - Лаборатория "Кибербезопасность"
  - Лаборатория "Медицинской информатики"
  - Лаборатория "Микро- и нанотехнологий"
  - Лаборатория "Новые функциональные материалы"
  - Лаборатория "Технических средств компьютерной томографии"
  - Лаборатория "Техническое зрение"
  - Научно- исследовательская лаборатория цифровой обработки сигналов
    - Конструкторско-технологический отдел
    - Научно-исследовательский отдел 
    - Отдел метрологии 
    - Отдел по техническому контролю
    - Производственный отдел
  
  
• Управление информации и коммуникационной политики
  - Отдел связей с общественностью
  - Редакция корпоративных медиа
  - Редакция газеты «Новгородский университет»
  - Отдел видеопроизводства
  - Отдел развития бренда

2. Проректор по образовательной деятельности:

• Заместитель проректора по образовательной деятельности
• Многофункциональный центр обучающихся (МФЦО)
  
• Управление образовательной деятельностью    
     - Отдел качества
     - Отдел ординатуры
     - Отдел планирования и мониторинга образовательной деятельности
     - Отдел расписания
     - Отдел среднего профессионального образования
     - Отдел инклюзивного образования НовГУ 
• Управление развития компетенций 
     - Отдел цифровой трансформации образования
        - Лаборатория искусственного интеллекта в образовании
        - Лаборатория образовательных технологий 
    - Центр дополнительного образования детей "Дом научной коллаборации имени С.В.Ковалевской" (ЦДОД "ДНК им. С.В.Ковалевской")
       - Отдел дополнительных общеобразовательных программ "Детский университет"
       - Отдел дополнительных общеобразовательных программ "Урок технологии"
      - Отдел дополнительных общеобразовательных программ, проект "Малая академия"
      - Отдел дополнительных профессиональных программ, проект "Педагог К-21"
      - Отдел организации приема 
    - Центр дополнительного образования и развития карьеры (ЦДОРК)
      - Лаборатория массажа и ароматерапии
      - Отдел развития компетенций
      - Сектор "Открытый русский язык"
• Центр "Школа проектного обучения" 
• Кафедра русского языка как иностранного
   - Центр русского языка и культуры 
• Научная библиотека 
     - Отдел информационных ресурсов и технологий 
     - Отдел обслуживания пользователей и хранения фондов 
     - Отдел формирования фонда и обработки документов 
• Подготовительное отделение иностранных студентов 
• Центр развития англоязычных образовательных программ 
• Университетский лицей точных и естественных наук
• Старорусский политехнический колледж, филиал НовГУ
• Представительство ФГБОУ ВО НовГУ им. Ярослава Мудрого в г. Боровичи 

• Инжиниринговый центр "Радиоэлектронного прототипирования"
      - Конструкторско-технологический отдел
      - Научно-исследовательский отдел
      - Отдел метрологии
      - Отдел технического контроля
      - Производственный отдел
• Научно-исследовательский центр 
     - Научные группы 
           - 10/ИТИС-гр.
           - 12/СП-2
           - 251/СК-1/Вареник А.С.
          - 28/ПТР-гр
          - 29/ПТР-гр
          - 35/ПТ-гр
           - 7/ИЭИС-гр.
           - 8 ГИ-гр
           - 915/ОЭФ-6/Гаврушко В.В.
    - Служба качества
• Отдел аспирантуры и молодежной науки 
• Центр "Геномного инжиниринга" 
     - Лаборатория "Биобанк, геномный инжиниринг" 
     - Отдел молекулярно-генетических исследований 
• Центр "Междисциплинарных исследований и разработок"
     - Лаборатория "BIM-технологий"
     - Лаборатория "Автономного транспорта"    
     - Лаборатория "Нейротехнологий"
     - Лаборатория "Промышленного Дизайна"
     - Лаборатория "Прототипирования"
     - Лаборатория "Робототехники и мехатроники"
  
• Центр развития публикационной активности НовГУ 
     - Отдел мониторинга и индексирования 
     - Отдел сопровождения конференционной активности 
     - Редакционно-издательский отдел 

• Контрактная служба
     - Отдел маркетинга, планирования и отчетности
     - Отдел размещения заказов
• Медицинский центр 
     - Амбулаторно-поликлиническое отделение 
     - Санаторий-профилакторий НовГУ  
• Управление бухгалтерского учета 
    - Отдел материального учета 
    - Расчетный отдел 
    - Финансовый отдел 
    - Отдел бухгалтерской отчетности и финансового контроля

• Учебно-клинический стоматологический центр 
• Финансово-экономическое управление 
•    - Отдел сводного планирования и анализа
     - Отдел штатного расписания и бюджетных ассигнований
• Центр общественного питания 
     - Кафе НовГУ 
     - Столовая ИГУМ
     - Столовая ИБХИ 
     - Столовая НовГУ 
     - Столовая Гуманитарно-экономического колледжа 
     - Столовая Института цифровой экономики, управления и сервиса
     - Столовая ИМО 
     - Столовая Политехнического колледжа 
• Центр профессионального образования "Водитель плюс" 
     - Отдел методического и психологического обеспечения подготовки водителей
     - Отдел по подготовке водителей автотранспортных средств(автомобилей)
     - Отдел производственного обучения вождению
     - Отдел технического обслуживания и ремонта 
        - Автомастерская 
  
• Юридическое управление 
     - Правовой отдел 
• Управление по работе с персоналом 
     - Отдел документационного обеспечения 
        - Архив 
     - Отдел кадров 
     - Служба охраны труда 
     - Центр обучения и повышения квалификации по охране труда 

5. Проректор по молодежной политике

• Управление молодежной политики 
     - Отдел воспитательной работы
     - Центр организации и сопровождения событий и творчества
     - Центр карьеры 
     - Центр оценки и развития надпрофессиональных компетенций
     - Центр физического развития и спорта
        - Спортивный клуб НовГУ

6. Проректор по развитию кампуса

• Административно-хозяйственное управление

 - Отдел общежитий
 - Отдел по строительству и ремонту зданий и сооружений
 - Транспортный отдел
 - Учебно-оздоровительный центр 
 - Отдел снабжения
 - Хозяйственный отдел
 - Инженерно-производственный отдел

• Отдел по управлению имущественным комплексом
  

• Департамент международного сотрудничества   
    -  Отдел международных образовательных программ и академической мобильности
    - Отдел миграционного учета, виз и регистраций
    - Отдел рекрутинга и работы с иностранными студентами
    - Российско-Германская Академия непрерывного образования
    - Центр корейского языка и культуры НовГУ
    - Центр сотрудничества с Италией
    - Центр сотрудничества с Францией
    - Центр сотрудничества со странами Северной Европы и Балтии

• Управление трансфера технологий и инноваций
  - Отдел маркетинга 
  - Центр "Фабрика пилотирования проектов Национальной технологической инициативы и Цифровой экономики" 
  - Центр поддержки технологий и инноваций НовГУ 
      - Отдел патентования 
• Центр "Пространство коллективной работы "Точка кипения Великий Новгород"

• Управление комплексной безопасности 
   - Отдел безопасности
   - Отдел гражданской обороны и чрезвычайных ситуаций
  
  
• Управление цифрового развития
  - Центр новых информационных технологий
      - Отдел обеспечения информационной безопасности
      - Отдел обслуживания и ремонта средств вычислительной и копировальной техники
      - Отдел сетевых технологий
      - Отдел телекоммуникаций и систем связи
  
  - Центр цифровых систем управления
      - Отдел бухгалтерско-финансовых СУБД
      - Отдел внедрения цифровых систем управления университетом
      - Отдел технического и мультимедийного сопровождения
      - Отдел цифровых технологий управления университетом 

Институт биотехнологий и химического инжиниринга
 - Дирекция Института биотехнологий и химического инжиниринга 
      - Отдел обеспечения деятельности 
      - Естественнонаучный музей ИБХИ
      -  Кафедра биологии и биоинформатики 
      -  Кафедра биологии, биохимии и биотехнологий
      - Кафедра геоэкологии и лесоустройства 
      -  Кафедра лесного хозяйства и земельных ресурсов  
      -  Кафедра технологии производства и переработки с/х продукции  
      -  Кафедра фундаментальной и прикладной химии 
      -  Кафедра экологии, географии и природопользования  
      -  Лаборатория геоинформационных систем 
      - Учебно-научная исследовательская лаборатория ИБХИ
          - Сектор биохимии и биомедицины
          - Сектор пищевого производства и сельскохозяйственной продукции
          - Сектор прикладной биотехнологии
          - Сектор фундаментальной и прикладной химии
      -  Центр дополнительного профессионального образования и повышения квалификации 

 Институт медицинского образования
  - Дирекция Института медицинского образования 
      - Аккредитационно-симуляционный центр 
      - Отдел обеспечения деятельности 
      - Кафедра акушерства,гинекологии и педиатрии 
      - Кафедра внутренних болезней 
      - Кафедра восстановительной медицины и остеопатии 
      - Кафедра госпитальной хирургии 
      - Кафедра дополнительного образования по стоматологическим специальностям 
      - Кафедра дополнительного профессионального образования и поликлинической терапии 
      - Кафедра микробиологии, иммунологии и инфекционных болезней
      - Кафедра морфологии человека 
      - Кафедра неврологии и психиатрии 
      - Кафедра нормальной физиологии 
      - Кафедра общей патологии 
      - Кафедра общественного здоровья, здравоохранения и общей гигиены 
      - Кафедра сестринского дела 
      - Кафедра специализированной терапии 
      - Кафедра стоматологии 
      - Кафедра фармации 
      -  Учебно-научный центр фундаментальной медицины 
      - Учебно-научный центр функциональных и эпидемиологических методов исследования 
      - Учебно-практический фармацевтический центр 
      -  Центр "Повышения квалификации фармацевтических специалистов" 
     - Центр международного сотрудничества ИМО
   - Медицинский колледж 

 Политехнический институт
  - Дирекция Политехнического института 
     - Отдел обеспечения деятельности
     - Лаборатория художественной обработки металла 
     - Кафедра архитектуры и реставрации
     -  Кафедра дизайна 
     - Кафедра промышленных технологий 
     - Кафедра строительного производства
     - Кафедра строительных конструкций 
     - Кафедра энергетики и транспорта 
     -  Уч.-науч.-произв. лаборатория "Реконструкция и реставрация зданий и сооружений" 
     -  Учебная научно-творческая мастерская "Урбанистика и колористика"
   -  Учебно-творческая мастерская прикладного дизайна и декоративного искусства
 - Региональный центр аттестации, контроля и диагностики
 - Лаборатория неразрушающего контроля
 -  Научно-образовательный центр безопасности дорожного движения и технической экспертизы