Учебный отдел Института медицинского образования вырполняет задачи планирования и организации учебно-методической работы университета. Решение вопросов организации учебной работы осуществляется совместно с руководством института, факультетов, кафедр. Принятые решения являются обязательными для исполнения в подразделениях, курируемых учебным отделом. Возглавляет отдел начальник отдела. Начальник учебного отдела в своей работе подчиняется непосредственно начальнику УМУ (зам. начальника УМУ - по вопросам, относящимся к их компетенции). Выполняет задачи по разработке учебных графиков и учебных планов, составляет расписание учебных занятий, зачетно-экзаменационных сессий и графиков текущей аттестации студентов, формирует базы данных учебного и учебно-методического назначения, собирает, обрабатывает и формирует базы данных по результатам текущей, семестровой и итоговой аттестации студентов. Осуществляет планирование и контроль использования аудиторного и лабораторного фондов, проведения учебных занятий, выполнения требований учебно-методических документов и учебной нагрузки профессорско-преподавательским составом кафедр. Контролирует успеваемость студентов и дает рекомендации на факультеты по совершенствованию учебного процесса. Следит за соответствием рабочих программ по учебным дисциплинам и методического обеспечения учебного процесса. Участвует в формировании и организации работы государственных экзаменационных комиссий, в организации практик студентов.
Деятельность учебного отдела ИМО направлена на повышение качества подготовки специалистов, модернизации учебного процесса в соответствии с современными требованиями, реализации стратегии развития образовательной деятельности университета.